熒光顯微鏡是指將紫外線作為光源，使其照射在樣品上，并使得樣品發光，從而實現觀察的一種顯微鏡，用于生物領域中研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等的工具。

熒光顯微鏡有兩個關鍵的概念，其一是放大倍數，其二是分辨率。

熒光顯微鏡放大倍數在熒光顯微鏡的觀察應用中，為了獲得良好的結果，用戶需要對顯微鏡的放大倍數有一定的了解，顯微鏡的放大倍數就是指在我們在顯微鏡下觀察一個樣品時，成像之后比原本放大了多少。

而在熒光顯微鏡中，分辨率剛好與其相反，實際意義上的分辨率指的是樣品成像之后，圖片能夠呈現出樣品的多少細節，這可能是主觀的，在技術層面上，分辨率受到光的折射特性的限制。

熒光顯微鏡還有一個概念是級限分辨率，它指典型的落射熒光照明復合顯微鏡無法分辨或區分距離小于200nm的兩個物體。此外，因為整個樣品被同時照射，所以樣品中所有聚焦和離焦的光線都被檢測到。這些限制意味著，根據物鏡中的鏡片，可能能夠確定一個細胞中的兩個不同顏色的探針，但是如果沒有很多對照、單像素分析和計算，就無法分辨它們之間的空間關系。

熒光顯微放大倍數與標尺之間的對應關系

50x標尺每一格代表20μm

100x標尺每一格代表10μm

200x標尺每一格代表5μm

400x標尺每一格代表2.5μm

500x標尺每一格代表2μm

1000x標尺每一格代表1μm

熒光顯微鏡的物鏡放大倍數允許有5%的誤差，所以使用前需要校準，步驟是：把物鏡測微尺（劃分為100小格，0.01mm/格）放在載物臺上，然后用相應倍率的物鏡和10*刻度目鏡（內有0.1mm格值的刻度尺）調焦成象后，進行觀察，物鏡測微尺與目鏡刻度尺重合的格數*0.01/目鏡刻度尺的格數即為物鏡在此倍率下每個刻度值的實際長度。

物鏡和目鏡加在一起標定總放大倍數。用物鏡測微尺當試樣看，上面有個1mm的尺子，分成100個小格，一個小格是10微米。你用帶有目鏡測微尺的目鏡去量上面標尺的長度，量出來數值，除以1mm真實長度，不就知道放大倍數了么。經常有單位說顯微鏡要讓計量局來計量。其實顯微鏡是分析儀器，不是強檢儀器。有時計量局來人計量，主要就是干這個活，計量你的放大倍數是不是在誤差之內。