倒置熒光顯微鏡是近年來逐步發展起來的一種新型顯微鏡種類，其特點是激發光從物鏡向下落射到標本表面，即用同一物鏡作為照明聚光器和收集熒光的物鏡。光路中需加上一個雙色束分離器，它與光鈾呈45度，激發光被反射到物鏡中，并聚集在樣品上，樣品所產生的熒光以及由物鏡透鏡表面、蓋玻片表面反射的激發光同時進入物鏡，反回到雙色束分離器，使激發光和熒光分開，殘余激發光再被阻斷濾片吸收。如換用不同的激發濾片、雙色束分離器、阻斷濾片的組合插塊，可滿足不同熒光反應產物的需要。

在倒置熒光顯微鏡的使用過程中，如果遇到設備出現故障，使用者可參考以下方法進行處理：

1、視場內無照明：

①未開啟電源開關：打開電源開關；

②安裝的照明燈泡不符合要求：使用符合要求的燈泡；

③電器底盤連接件接觸不良：檢查并送專業維修；

④保險絲損壞：更換新保險絲。

2、電源箱電壓表與電流表指示不斷升高：

汞燈已超出使壽命：更換新的汞燈；

3、電源箱電壓表與電流表指示不斷擺動：

①汞燈已超出使壽命：更換新的汞燈；

②電源箱內部電路有損壞：檢查并送專業維修。

4、視場邊緣有黑影或視場照明不均勻，不能觀察完整的視場：

①轉換器未轉入到定位點：轉動轉換器到定位位置；

②聚光系統因偏離而遮擋照明光路：將聚光系統轉入光路至定位位置；

③物鏡、目鏡或聚光鏡表面霉漬或油污：擦拭鏡片表面或更換；

④照明燈絲像偏離集光鏡中心：調整照明燈泡的位置。

5、離焦或分辨率低：

①物鏡損壞：修配物鏡（需專業維修）；

②孔徑光闌孔徑開得太小：根據所使用物鏡倍率調整孔徑光闌孔徑大小；

③標本蓋玻片太厚或太薄：按物鏡要求加裝蓋玻片；

④物鏡偏離光路：轉動轉換器到定位位置。